Postdoktor i djupinlärningsmodellering av tumörmiljön
Karolinska Institutet
- Stockholm
- Tillfälligt
- Heltid
Labbet är beläget i Science for Life Laboratory (SciLifeLab) och tjänsten finansieras av Data Driven Life Science-programmet (DDLS).Din rollDu kommer att utveckla en djupinlärningsmodell av tumörmiljön (tumor microenvironment, TME) i pankreascancer med målsättningen att identifiera nya terapeutiska mål och biomarkörer för att modifiera TME för att förbättra behandlingsresultaten.I denna postdoc tjänst kommer du att:
- Designa ett högkapacitetsscreeningsexperiment av stimuli-respons i cancer- och stromaceller, som kommer att utföras av vår forskningsinfrastruktur (core facilities).
- Träna en modell för att predicera ligandmönster i TME från patientdata, vilket kan förbättra klassifikationen av sjukdomstillstånd och identifiera potentiella biomarkörer.
- Utvidga modellen för att simulera dynamiska interaktioner mellan pankreascancer och stroma-celler för att avslöja stabila ligandsekretionsmönster.
- Förutsäga molekylära mål inom nätverken för pankreascancer och stroma som kan modifiera TME för att förbättra patientutfallen.
- Starka programmeringskunskaper i språk så som Python.
- Erfarenhet av analys av data från högkapacitetsscreening.
- Dokumenterad förmåga att bedriva självständig forskning och effektivt kommunicera resultat.
- Högmotiverad med förmågan att arbeta både självständigt och i team.
- Goda kunskaper i skriftlig och muntlig engelska.
- God kännedom om cancerbiologi, särskilt tumörmiljön.
- Erfarenhet av djupinlärningsmodeller och automatisk differentiering.
- Erfarenhet av GitHub eller andra versionskontrollsystem.
- Erfarenhet av att utforma högkapacitetsscreeningsexperiment.
- En komplett CV inkluderande disputationsdatum, avhandlingens titel, tidigare akademiska befattningar, akademisk titel, nuvarande befattning, akademiska utmärkelser samt kommittéarbete
- En komplett publikationslista
- En sammanfattning av nuvarande arbete (maximalt en sida)