Postdoktor inom Bayesiansk inferens för tillämpningar inom cellbiologi
Uppsala universitet
- Uppsala
- Tillfälligt
- Heltid
Tekniska framsteg inom bildanalys av celler har resulterat i en mängd cellbildsdata som visar hur cellpopulationer ändras i tid och rum. Dessa data innehåller rik information om hur celler agerar och interagerar med varandra. I detta forskningsprojekt utvecklar vi matematiska och probabilistiska modeller som kvantifierar cellbeteenden och cell-till-cell-interaktioner från dynamiska punktmönster (där punkter representerar cellkoordinater) som extraheras från bilddata.Den postdoktorala forskarens huvuduppgift blir att utveckla Bayesianska inferensmetoder och beräkningsmatematiska pipelines vars syfte är att uppskatta matematiska modeller från dynamiska punktmönsterdata. Modell-inferens kommer huvudsakligen att göras med hjälp av ett probabilistiskt programmeringsramverk, såsom Stan.Dessutom kommer postdoktorn att:
- samarbeta med ett tvärvetenskapligt team av experter inom matematik, statistik, maskininlärning och preklinisk cancerforskning,
- leda vetenskapliga manuskript och presentera forskningsresultat på internationella konferenser,
- ha möjlighet att undervisa (upp till 20%),
- ha möjlighet att handleda studenter.
Doktorsexamen i tillämpad matematik, statistik, maskininlärning, biofysik, eller ett liknande ämne eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen i ett av dessa ämnen. Examen ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Främst bör den komma ifråga som har avlagt examen för högst tre år sedan. Vid beräkning av ramtiden om tre år är utgångspunkten sista ansökningsdag. Om det finns särskilda skäl kan sådan examen ha avlagts tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer, etc.Sökande bör vara lagspelare med utmärkt kommunikationsförmåga. Kunskaper inom matematisk problemlösning och programmeringskunskaper krävs. Inga förkunskaper inom cancerbiologi krävs men sökande bör ha ett genuint intresse av att använda matematik, statistik och beräkningsmetoder för att bättre förstå cancer.Önskvärt/meriterande i övrigt
Forskningserfarenhet inom ett eller flera av följande ämnen är meriterande (utan inbördes rangordning):1. Bayesiansk inferens/ probabilistisk modellering.
2. Beräkningsstatistik.
3. Markov chain Monte Carlo metoder som Hamiltonian Monte Carlo.
4. Programmering i Python, R, Mathematica.
5. Programmering i Stan eller liknande probabilistiska programmeringsramverk.
6. Fourieranalys.
7. Matematisk biologi.
8. Matematisk modellering.Om anställningen
Anställningen är tidsbegränsad i 2 år enligt centralt kollektivavtal. Omfattningen är heltid. Tillträde 1a augusti 2024 eller enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala.Upplysningar om anställningen lämnas av: Biträdande universitetslektor Sara Hamis, (+46) 18-471 1061, sara.hamis@it.uu.se.Välkommen med din ansökan senast den 29 april 2024, UFV-PA 2024/856.Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 600 anställda och 53 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitethttps://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/ Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp. Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem. Anställningsform: tidsbegränsad anställning | Anställningens omfattning: heltid | Antal lediga befattningar: 1 | Sysselsättningsgrad: 100% | Ort: Uppsala | Län: Uppsala län | Land: Sweden | Referensnummer: UFV-PA 2024/856 | Facklig företrädare: Seko Universitetsklubben seko@uadm.uu.se, ST/TCO tco@fackorg.uu.se, Saco-rådet saco@uadm.uu.se, | Publicerat: 2024-03-11 | Sista ansökningsdag: 2024-03-25